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DESCRIPTION:Colloque de Modélisation Mathématique et Informatique des Systèmes Complexes \nDélégation régionale Ile-de-France de l’IRD\n\nConférenciers invités: \n\nMarc Bui\, CHArt\nYann Chevaleyre\, LIPN\nPatrick Giraudoux\, Chrono-environnement\nChristophe Lang\, Femto-ST\nFabien Michel\, LIRMM\nMaurice Tchuenté\, UMMISCO\navec la participation des doctorants du PDI-\n\n\n\nA propos de l’événement\n\n\nDepuis 2010 le Campus IRD de Bondy ouvre ses portes à la communauté des sciences de la complexité avec la conférence CoMMISCo. CoMMISCo est un moment de partage et de convivialité\, un formidable lieu de rencontre entre chercheurs du Nord\, du Sud et des doctorants du Programme Doctoral International “Modélisation de Systèmes complexes” (PDI MSC) créée par Université Paris 6 UPMC avec l’IRD. \nParce que la complexité est une question de fond qui intéresse un large public\, la conférence est ouverte et gratuite à toute personne désireuse de mieux comprendre la spécificité des approches de modélisation des systèmes complexes. \nAu cours de ces 3 jours\, les 20 doctorants issus des 12 pays du programme doctoral et les 8 conférenciers présenteront des questions de recherches\, multidisciplinaires sur des sujets sensibles (environnement\, écologie\, biologie\, sciences économiques sociales\, etc.) \nConférence au fil de l’eau\nLe mercredi 23 novembre\, nous organisons une conférence “Au fil de l’eau”\, sur le canal de St Martin\, entre le Bassin de la Villette et Jussieu. \nLors de cette conférence fluviale\, présentations et posters seront agrémentés d’un pique-nique offert aux inscrits. Le nombre de places étant limité\, une inscription dans les meilleurs délais est fortement recommandée. \nMerci de bien vouloir nous l’indiquer en remplissant le formulaire d’inscription \nVous pouvez nous contacter par e-mail à l’adresse : commisco@googlegroups.com. \n\nInscriptions\n\n\nInscription gratuite\, mais le nombre de places est limité ! \nMerci de bien vouloir vous inscrire en remplissant le formulaire : https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSfdGzXLhXL4s-edZeR1shn-4a-Df4LI2kdEvU7Q4TPoiaPTbg/viewform
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SUMMARY:« Big Data » en biologie et médecine : nouveaux outils\, nouveaux concepts ?
DESCRIPTION:Durant les mois de novembre et décembre 2016\, le labex TransferS et Michel Morange (République des Savoirs) accueillent Béatrice DESVERGNE\, professeur à la Faculté de Biologie et de Médecine de Université de Lausanne (Suisse). \n« Big Data » en biologie et médecine : nouveaux outils\, nouveaux concepts ? \nCes dix dernières années a vu l’émergence d’une nouvelle approche en biologie\, appelée biologie des systèmes\, qui s’appuie sur l’acquisition de données aussi exhaustives que possible concernant le système à l’étude. Ces données sont d’ordre génétique (ex : séquence du génome)\, moléculaires (ex : niveau d’expression de tous les gènes)\, phénotypiques (ex : pression artérielle\, poids\, mesures issues d’objets connectés)\, et aussi d’ordre qualitatif tel que des images ou radios. Une interprétation appropriée de l’ensemble massif de ces données –d’où le nom « Big Data »\, devenu très médiatisé\, ou mégadonnées– serait la porte ouverte à une compréhension intégrative des phénomènes du vivant\, tant physiologiques que pathologiques. De ce fait\, autant en biologie fondamentale qu’en médecine\, dans le cadre de la médecine dite personnalisée\, cette approche suscite d’énormes attentes\, alors même que de nombreux défis restent à adresser. L’enjeu est non seulement scientifique\, mais aussi sociétal\, économique\, et politique. \nLes quatre séminaires proposés dans le cadre de la mission de professeur invité vont permettre de retracer les développements récents de la recherche en biologie\, depuis les fondements\, les succès et les limites de la biologie moléculaire à la transformation actuelle des concepts en biologie provoquée par les « Big Data »\, pour finalement se poser la question\, dans ce contexte\, des réalités et promesses de la médecine personnalisée. \nProgramme des séminaires\nMercredi 16 novembre\, 13h30-15h30\, ENS – Salle de colloque Centre Cavaillès (29 rue d’Ulm – 3e étage)\nLa démarche scientifique en biologie moléculaire : puissance et limites\nDiscussion sur le type de questions posées par les biologistes moléculaires\, les outils utilisés\, et les réponses obtenues avec leurs limites. \nMercredi 23 novembre\, 13h30-15h30\, ENS – Salle de colloque Centre Cavaillès (29 rue d’Ulm – 3e étage)\nL’avènement des « Big Data » en Biologie et Médecine : un changement de paradigme ?\nDiscussion sur la nature des Big Data\, sur leur utilisation aujourd’hui en recherche en biologie et médecine\, sur les défis connus et ceux qui émergent\, mise en parallèle avec les Big Data en économie\, en lettre\, en physique. \nMardi 6 décembre\, 13h30-15h30\, ENS – Salle de colloque Centre Cavaillès (29 rue d’Ulm – 3e étage)\nModèles et Modellingen biologie et médecine à l’ère des Big Data\nDiscussion sur les concepts qui sous-tendent la notion de modèles\, les différentes approches de modelling\, les propriétés des modèles explicatifs proposés à l’issue d’une recherche spécifique\, des modèles descriptifs et des modèles prédictifs. \nMardi 13 décembre\, 13h30-15h30\, ENS – Salle à déterminer\nBig Data et médecine personnalisée : réalités\, promesses… et leurre ?\nDiscussion revenant plus spécifiquement sur l’intrication « Big Data »\, complexité\, et médecine personnalisée. Lien avec le développement de la modélisation\, entre réalités\, promesses et leurre. \n\nBéatrice Desvergne was trained as a MD and specialized in Anesthesiology and Resuscitation. Along practicing medicine\, she carried out research in experimental biology in ISNERM Rennes. After a post-doctoral stay from 1988 to 1992 at NIH in Bethesda\, she was appointed as assistant professor at the University of Lausanne\, and further promoted as associate and now full professor at the Center for Integrative Genomics. In addition to her teaching and research activities\, she has been the Dean of the Faculty of Biology and Medicine from 2012 to 2015. Her research activities focus on questions and models on the nuclear receptor family of transcription factors -more particularly on Peroxisome Proliferator Activated Receptors (PPARs)\, which play a major role in metabolic homeostasis. The major hallmark of her work is the combination of in-depth molecular approaches and complex phenotypic evaluation of mouse models\, aiming at elaborating integrative views. In parallel to experiment-oriented questions\, the systemic approaches she is using lead her to develop a major interest in how giving sense to the wealth of data generated in the field of metabolism by the « omics » approaches\, in biology as well as in medicine. Her broad interest in interdisciplinary sciences made her an important actor in organizing teaching around sciences\, techniques\, and society for medical and biology students at the university of Lausanne.
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SUMMARY:Formation JEDI – OpenMole
DESCRIPTION:Modéliser autrement avec OpenMOLE. \nAujourd’hui\, le modélisateur construit des codes de calcul toujours plus complexes mettant en jeu de nombreux paramètres\, traitant des jeux de données toujours plus importants. La compréhension par les chercheurs du comportement de leurs propres modèles est devenu ardue\, le traitement des données sur des machines personnelles : impossible. C’est à ce\ndouble défi que s’attaque OpenMOLE\, plateforme numérique proposant des\nméthodes de haut niveau appliquées directement sur les codes des modélisateurs et qui sont distribuées à grande échelle de manière transparente sur n’importe quel type d’infrastructure. \nCette formation permet de prendre en main la plateforme\, de construire des workflows simples et de déléguer le calcul sur des environnements de calcul haute performance. \nVeuillez sélectionner un formulaire valide
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