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SUMMARY:Annotation fonctionnelle et interprétation de données protéomique avec ProteoRE
DESCRIPTION:Avec la production accrue de données de protéomique à grande échelle (notamment par spectrométrie de masse)\, l’un des verrous porte désormais sur notre capacité à annoter et explorer ces longues listes de protéines en vue de leur interprétation biologique. ProteoRE (Proteomics Research Environment\, http://www.proteore.org ) est une infrastructure centralisée disponible en ligne qui permet aux utilisateurs biologistes/cliniciens sans expérience de programmation\, d’interpréter leurs données de protéomique de façon interactive\, reproductible et collaborative. Construit sur l’environnement Galaxy\, ProteoRE permet d’exécuter des outils d’annotation et de visualisation graphique\, de construire et de partager des chaînes complètes d’analyse via des interfaces utilisateurs documentées. \nObjectifs : les participants apprendront comment utiliser les fonctionnalités du site ProteoRE pour interpréter et manipuler des données de protéomique sur la base de deux études de cas réels: i. annotation du protéome d’un échantillon biologique ; ii. conception et mise en œuvre d’une stratégie de sélection de candidats biomarqueurs. L’accent sera mis principalement sur les aspects pratiques\, des présentations sur les sources de données et les méthodologies d’annotation utilisées seront également faites. A l’issue de cette formation\, les participants devront être capables de manipuler leur données (filtrage\, comparaison croisée\, conversion d’identifiants)\, d’annoter les protéines\, de réaliser des analyses fonctionnelles (tests d’enrichissement\, analyses en réseaux)\, de gérer\, extraire et partager leurs résultats sous Galaxy à des fins de publication (textes\, graphiques\, workflow et historique). \nInscription :http://migale.jouy.inra.fr/?q=fr/proteore2019 \n 
URL:https://iscpif.fr/evenements/annotation-fonctionnelle-et-interpretation-de-donnees-proteomique-avec-proteore/
LOCATION:ISC-PIF\, 113 rue Nationale\, Paris\, Paris\, 75013\, France
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SUMMARY:3e session de l'Incubateur de médiation scientifique CNRS/AMCSTI/ISC-PIF
DESCRIPTION:Dans le cadre du dispositif Com’Lab\, la direction de la communication du CNRS et l’AMSCTI lancent un incubateur de médiation scientifique en association avec l’Institut des Systèmes Complexes de Paris/Île-de-France. Les Systèmes Complexes ont été choisis comme thématique de l’année 2018-2019. \nL’objectif est d’encourager la collaboration à l’échelle nationale entre organismes de recherche et centres de culture scientifique et d’accompagner sur 9 mois la conception et l’implémentation de projets de médiation innovants et grand public.
URL:https://iscpif.fr/evenements/3e-session-de-lincubateur-de-mediation-scientifique-cnrs-amcsti-isc-pif/
LOCATION:ISC-PIF Amphithéâtre\, 11 place Nationale\, Paris\, 75013
CATEGORIES:ISC-PIF Auditorium,Private
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