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SUMMARY:Formation WF4Bioinfo 2025
DESCRIPTION:L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) organise en partenariat avec iPOP-UP (représenté par EDC) une formation sur les langages de workflows en bioinformatique à destination des bioinformaticien·ne·s et des bioanalystes. La formation abordera les fondamentaux et les fonctionnalités avancées des deux langages Snakemake et Nextflow. Ces outils sont en effet devenus indispensables pour assurer la reproductibilité et l’efficacité des analyses bioinformatiques. La formation sera structurée en trois séquences : \n  \nune journée commune qui abordera les grands principes des gestionnaires de workflow\, en particulier dans le domaine de la bioinformatique et en lien avec les infrastructures de calcul de type cluster et cloud proposés au sein de l’IFB\nune journée de session pratique avec 1 atelier snakemake (v.8) et 1 atelier nextflow (DSL2) en parallèle au choix des participants. Nous proposons aux participants qui le souhaitent de travailler sur leur propre workflow dans une approche “Bring your own script” avec l’aide de l’équipe pédagogique.\nune demi-journée « Bring your own script ».\nObjectifs pédagogiques\nA la fin de cette formation les participants : \nauront acquis les bases et connaîtront les fonctions avancées des gestionnaires de workflows\nauront écrit et/ou converti un workflow d’analyse (apporté par le participant ou proposé par l’équipe pédagogique) dans le langage de leur choix (Snakemake v.8\, Nextflow DSL2)\nauront exécuté et optimisé leur workflow sur le cluster ou le cloud mis à disposition par l’IFB\nPré-requis\nMaîtrise d’unix et d’un langage de ligne commande (bash ou équivalent)\nAvoir déjà exécuté au moins une analyse avec un gestionnaire de workflow (Snakemake\, Nextflow ou équivalent) sans avoir obligatoirement développé le workflow\nSavoir travailler dans un environnement de type cluster et/ou cloud
URL:https://iscpif.fr/evenements/formation-wf4bioinfo-2025/
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SUMMARY:Réunion de lancement du projet LifeLine - PEPR Mathématiques et Sciences du Vivant
DESCRIPTION:Réunion de lancement du projet LifeLine en présence des membres de l’ANR et du PEPR Math-ViVes.\nLe projet LifeLine vise à définir et à étudier un nouveau cadre mathématique d’aide à la décision pour les systèmes socio-écologiques (SES) dans un contexte multi-acteurs.\nL’enjeu principal est d’obtenir des stratégies satisfaisantes à la fois pour les acteurs locaux et l’écosystème global\, et surtout sur le long terme.
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SUMMARY:Entretien climatisseur
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SUMMARY:Rentrée des SG
DESCRIPTION:Réunion de rentrée à destination des SG de notre délégation
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SUMMARY:Réunion INSERM privée
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