Salma Mesmoudi, ingénieure de recherche à l’Université Paris Panthéon-Sorbonne et chercheuse résidente à l’ISC-PIF, récoit le Prix de l’Innovation CNRS pour la plateforme LinkRdata.
AI DataLab pour démocratiser l’accès à la connaissance en neuroimagerie
Le principal défi auquel est confrontée la science aujourd’hui, et plus particulièrement la neuroimagerie, est l’accès à la connaissance. Cet accès est de plus en plus entravé par plusieurs obstacles majeurs : la complexité des formats de données, l’utilisation de logiciels spécialisés nécessitant des compétences avancées, et l’insuffisance des infrastructures de calcul et de stockage. Ces difficultés affectent particulièrement les petits laboratoires et freinent considérablement le transfert de la recherche vers le monde non académique.
Pour répondre à ces défis, notre projet vise à démocratiser l’accès à la connaissance en neuroimagerie à travers la création d’une plateforme en ligne appelée “IA DataLab”. Cette plateforme, à la fois évolutive et intégrative, rassemble logiciels et données issus de la recherche et propose une infrastructure informatique mutualisée. Elle permet aux utilisateurs d’accéder aux ressources via un navigateur sécurisé, sans avoir besoin d’installer de logiciels complexes.
L’IA DataLab intègre des logiciels couramment utilisés en neuroimagerie et automatise les étapes de pré-traitement et de traitement des données. Les utilisateurs peuvent ainsi choisir entre des workflows standards ou personnaliser les workflows en fonction de leurs besoins spécifiques.
À la fin du traitement, la plateforme offre plusieurs possibilités de visualisation des résultats. De plus, les utilisateurs peuvent enrichir leurs données en les comparant à la littérature scientifique, au transcriptome ou aux atlas cérébraux grâce à l’outil linkRdata. Ils peuvent également associer leurs résultats à d’autres bases de données pharmacologiques ou cellulaires, afin de pousser leurs analyses encore plus loin.
En proposant une solution centralisée et accessible, IA DataLab permet de surmonter les obstacles actuels, favorisant ainsi une recherche collaborative et inclusive en neuroimagerie.
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