Cartographie des connaissances liées au coronavirus

Lorsqu’une nouvelle variété de virus apparaît, un des premiers enjeux est d’arriver à synthétiser la masse de connaissances accumulée par la Science jusqu’alors sur des problématiques biologiques connexes.

L’équipe de l’ISC-PIF est spécialisée dans la fouille de données textuelles et la cartographie de connaissances. Elle vous propose ici des cartographies de pans de littérature liés au coronavirus effectuées avec le logiciel Gargantext.

Aperçu du voisinage de “antiviral activity” dans un carte Gargantext de Coronavirus.

Cartographie de la recherche sur le coronavirus

FÉVRIER 2020

Cette cartographie a été effectuée le 7 février 2020 sur une base de méta-données d’articles extraits de PubMed sur la période 2000-2020 (6560 articles). Elle recense quelques 2000 concepts liés au coronavirus et montre comment ils sont mis en relation dans la littérature. En particulier, on constate que les termes les plus fortement associés dans la carte dite “distributionnelle” avec les notion de anti-viral activity et anti-viral effect, sont la chloroquine et le Ch25h.

Cette carte est destinée avant tout aux professionnels de santé qui ont les connaissances pour l’interpréter et bénéficier de ses apports heuristiques. Elle peut néanmoins être utile à toute personne souhaitant avoir un point de vue synthétique et un accès détails aux articles traitants des enjeux autour du coronavirus.

AVRIL 2020

The majority of papers published on coronavirus have been published these last four months. There was a need to give an overview of this literature in order to better understand what are the focal points of the current research and what was still unexplored. These maps has been realized using Gargantext from a PubMed Corpora with query “covid-19 OR coronavirus” on April 29 2020 (7.2k documents from Jan 2020 to April 28 2020). The methodology is described here

When you click on a term, the most related terms are displayed in a tag cloud on the right along with the Publications from PubMed that mention the most the selected terms.

Cartographie des recherches sur les antiviraux

Cette cartographie a été effectuée le 5 avril 2020 sur une base de méta-données de 16.970 articles extraits de PubMed sur la période 2000-2020. Elle recense quelques 1300 concepts liés autour des antiviraux et montre comment ils sont mis en relation dans la littérature.

Cette carte est destinée avant tout aux professionnels de santé qui ont les connaissances pour l’interpréter et bénéficier de ses apports heuristiques. Elle peut néanmoins être utile à toute personne souhaitant avoir un point de vue synthétique et un accès détails aux articles traitants des enjeux autour du coronavirus.

Pour plus de détails sur cette carte, consulter la version interactive.

Cartographie des recherches autour de la Chloroquine et Hydroxychloroquine

Suite à la polémique autour de ce médicament, nous avons cartographié 20 ans de recherche sur le sujet à partir des données disponibles sur PubMed. Cela permet de se rendre compte rapidement des effets positifs et des effets secondaires qui ont déjà été observé autour de ce médicament. En particulier, le terme le plus fortement associé dans la carte dite “ditributionnelle” à anti-viral activity est “human coronavirus“.

Cette carte est destinée avant tout aux professionnels de santé qui ont les connaissances pour l’interpréter et bénéficier de ses apports heuristiques. Elle peut néanmoins être utile à toute personne souhaitant avoir un point de vue synthétique et un accès détails aux articles traitants des enjeux autour de la chloroquine et de l’hydroxychloroquine.

Pour plus de détails sur cette carte, consulter la version interactive.